“你，來當我的助手吧” 容易被捲入麻煩的少年·君塚君彥，在飛行於一萬米高空的客機中，成為了與“世界的敵人”作戰的“名偵探”少女·希耶絲塔的助手。 在那之後，兩人在長達三年的時間里飛遍世界各地，展開了令人目眩的神奇冒險，然後在激鬥的最後——經歷了生離死別。 希耶絲塔死後過了一年。 在獨自活下來的君塚身邊，出現了一位自稱是委托人的少女·夏凪渚。 接受了她的委托而再次成為助手的君塚，終於觸及了“名偵探”死亡的真相——。 然而，接觸到真相後，君塚等人逐漸知曉了。 完美無缺的名偵探所犯下的失誤。 以及繼承“名偵探”遺志的真正含義。 偵探已經，死了。 死亡的真相也已揭曉。 但是，距離尾聲還為時尚早。