全人類被神奇的現象一瞬間石化後過了幾千年——擁有超人般頭腦、天生的科學少年·千空蘇醒了。
在文明遭到毀滅的石頭世界里,千空集結新夥伴的力量一起建立“科學王國”,最終目標是用科學的力量復原整個世界。但是,由靈長類最強的高中生獅子王司領導的“武裝帝國”卻步步為營。旨在凈化人類的司試圖通過使用強大的力量來阻止科學的發展。
科學 vs 武力的戰鬥經過激戰,千空等人的科學王國占優勢,之後兩國終於和解。
由於同伴的謀反而處於冷休眠狀態的司為了復活全人類,科學王國以石化光線的發生源、地球的背面·新世界作為目標!
沖出世界解開石化之謎!石頭世界大航海時代終於開幕——‼