故事發生在“胡蘿卜事件”後5年。 男主人公原野的父母在事件中被流浪犬靈所傷致死,人形寵的殘暴給原野內心留下了嚴重的創傷。他獨自生活在城市的平民區,以開“黑出租”為生,排斥一切人形寵。
一天一個奇怪的乘客被人追殺,將一個裝有兔子的紙箱交付給原野保管,並約定過一段來拿回。夜晚,六只兔子變成了六名少女。原野因為對人形寵的煩感和排斥在加上生活壓力,準備將其丟掉,但是由於種種原因都沒有實現。而此時,尤里先生已經掌握原野收留六只兔靈的消息。但迫於人形寵不能攻擊人類的公約,尤里組織分別採取了“偷取”、“設計誘騙”、“暴力搶奪”等方式致兔靈於死地。
原野在與兔靈的相處過程中,從最初對於所有人形寵的排斥到對人形寵有了客觀認知,甚至與兔靈產生了微妙的情感,完成了自我的內心救贖。
原野最終決定與無辜的兔靈一同對抗尤里組織......