這是一個人類和妖怪共存的世界,在妖怪的國度里,鬼太郎(溫茲瑛士 飾)和朋友們過著無憂無慮的生活。然而,某一日,封印著人類邪念的妖怪石忽然下落不明,使得整個妖界陷入了恐慌之中,這塊石頭若是落到了心術不正之徒的手中,後果恐怕不堪設想。
與此同時,一位名叫三浦健太的小學生寫信給鬼太郎,聲稱家鄉為了修建主題公園而拆毀了稻荷神社,並因此激怒了妖怪,造成靈異事件頻發的糟糕局面。讓鬼太郎沒有想到的是,妖怪石幾經輾轉,竟然落到了三浦健太的手中。貪婪邪惡的妖怪空狐一直渴望著得到妖怪石以獲得強大的力量,在妖怪石的引導之下,空狐漸漸逼近三浦健太的身邊。