故事發生在風景秀麗的密西西比河畔,湯姆(喬納森·泰勒·托馬斯 Jonathan Taylor Thomas 飾)自幼喪母,是一個身世可憐的孤兒。然而,在朋友和親戚們的幫助和扶持下,湯姆還是成長為了一個快樂勇敢的男孩。哈克貝利(布拉德·蘭弗洛 Brad Renfro 飾)是湯姆最好的朋友,兩個孩子在一起,常常惹出各種各樣的麻煩,鬧了數不清的笑話。
一次偶然中,湯姆竟然成為了一宗凶殺案的目擊證人,由於害怕遭到凶手的報復,湯姆和哈克貝利決定離家出走,踏上逃亡的旅途。湯姆的失蹤讓親人倍感焦急,可他卻在孤島上開闢了自己的小天地,過得逍遙快活。最終,在案件即將審判之時,湯姆站了出來說出了真相,幫助法官做出了公正的判決。