轉眼間已經是1979年,第二代教父麥克•柯里昂(阿爾•帕西諾 飾)到了垂暮之年,為了靈魂的救贖,麥克慢慢結束家族的黑道事業,轉投正當生意。
麥克的兒子托尼酷愛藝術,無意接手家族事業,邁克爾決定讓大哥遜尼的私生子,火爆好色的文森(安迪•加西亞 飾)繼承家業,當第三代教父。麥克的愛女瑪麗(索菲婭•科波拉 飾)和文森相戀,遭到父親的反對,父女漸漸疏遠。
為了使家族資產合法化,麥克通過在梵蒂岡教廷的關系網,準備投資“屹立”集團,卻遭到敵人的暗中阻撓,教皇的去世也讓事情更加撲朔迷離。
麥克無奈之下,只能重新選擇用暴力解決問題,他的親人也被捲入了這場血雨腥風。